ความผิดปกติแต่กำเนิดประเภทหนึ่งที่พบได้บ่อยคือความบกพร่อง

ความผิดปกติแต่กำเนิดประเภทหนึ่งที่พบได้บ่อยคือความบกพร่องของผนังกั้นหัวใจห้องบน ซึ่งพบรูในผนังกั้นหรือกะบังระหว่างเอเทรียมขวาและเอเทรียมซ้าย หรือระหว่างหัวใจห้องล่างขวาและหัวใจห้องล่างซ้าย ข้อบกพร่องที่พบบ่อยที่สุดคือการคงอยู่ของ foramen ovale ซึ่งเป็นช่องเปิดในกะบังหัวใจห้องบนที่ปกติก่อนคลอดและควรปิดเมื่อคลอดหรือหลังจากนั้นไม่นาน รูระหว่างหัวใจทั้งสองด้านทำให้เกิดการผสมที่ผิดปกติของเลือดที่มีออกซิเจนจากการไหลเวียนของปอดและเลือดที่ขาดออกซิเจนจากการไหลเวียนของระบบ นอกจากนี้ยังทำให้เกิดการลัดวงจรซึ่งเลือดไหลผ่านปอดมากกว่าอวัยวะอื่น ๆ ของร่างกาย ในที่สุดภาวะดังกล่าวอาจทำให้ผนังหลอดเลือดแดงในปอดหนาขึ้นรวมถึงความดันโลหิตสูงในปอด โรคหัวใจ (ความดันโลหิตสูง) ความเครียดที่เพิ่มขึ้นอาจถูกวางไว้ที่หัวใจห้องล่างขวาในขณะที่มันพยายามสูบฉีดเลือดผ่านวงจรปอดเพื่อรับออกซิเจน จากนั้นอาจเกิดภาวะหัวใจล้มเหลวด้านขวา และเลือดที่เติมออกซิเจนอย่างเหมาะสมไปยังเนื้อเยื่อของร่างกายอาจลดลง ข้อบกพร่องของห้องโถงใหญ่และโพรงสามารถซ่อมแซมได้โดยง่ายและประสบความสำเร็จอย่างมากตราบเท่าที่ความดันโลหิตสูงในปอดที่รุนแรงและไม่สามารถย้อนกลับได้ยังไม่พัฒนา